蛇口口岸
蛇口口岸位于珠江口东岸、深圳市西部南头半岛南端，是我国改革开放后第一个由企业自筹资金建设管理和经营的国家一类口岸，该口岸从1979年8月开始动工兴建，1981年9月经国家批准对外开放。年设计吞吐量货物为1000万吨、集装箱为60万标箱、旅客为500万人次。蛇口港货运码头进港航道及港池水深为-10.7米，10万吨级货轮可自由进港。现已建成客、货运及集装箱生产性泊位33个。其中客运泊位15个，油码头泊位2个，修船泊位3个，散杂货泊位11个，集装箱专用泊位2个，万吨级以上的深水泊位有8个。目前，该港已由原来只为南海石油服务的后勤基地，发展为能承担内外客运与货运，集铁路、公路、水路等运输方式为一体的大型综合性口岸。蛇口港区客运码头港澳航线每天有14班高速豪华客船往返穿梭蛇口至港澳之间。其中往返香港有13个对开26个航次，往返澳门有1个对开2个航次。1999年8月15日正式开通蛇口客运码头至香港的夜航，延长口岸开放时间，为两地旅客和外商提供更加便捷的服务。
文锦渡口岸
文锦渡口岸是以供港鲜活产品过境为特点的公路客、货运综合性公路口岸。位于深圳市罗湖区南面、香港新界北面，由两座公路桥与新界香港相连。
文锦渡口岸是改革开放前深圳仅有的两个陆路口岸之一。1978年经国务院批准对外开放。改革开放前，文锦渡只是供港鲜活商品的贸易口岸，1978年10月建成公路桥，1985年2月新建一座公路桥，实行入出境车辆分桥行驶。配合治理深圳河工程，原出入境桥被拆除，新建一座出入境双向桥于2005年2月正式投入使用。经过多年来的不断改造，目前口岸区域占地面积13万多平方米，共有20条汽车检查通道，其中，小汽车、客车检查通道2条(入、出境各1条)，货车检查通道18条(入境10条，出境8条)。另有12条入出境旅客检查通道(入、出境各6条)。口岸的总体设计是：日汽车流量10000辆次，日旅客流量3000人次。1991年入出境车辆335万辆次，日均9181辆次，2004年，经该口岸入出境车辆277万辆次，日均7562辆次，年均下降0.5％。这是由于皇岗口岸投入使用分流等因素造成的。1997年后，该口岸入出境车辆稳定在日均7000辆左右。
货检每日7：00时开闸，22：00时关闸，运行15小时；旅检每日7：00时开闸，22：00时关闸，运行15小时。